清末民国时期,境内无进出口商品检验机构,所有进出口商品的检验,均由出口口岸所属的商品检验机构进行,多数进出口商品在武汉、广州两地检验。中华人民共和国成立后至70年代后期,进出口商品由对外贸易部武汉商品检验局长沙检验分处(后改为长沙商品检验局)进行检验。

1979年5月,成立岳阳商品检验处,隶属长沙商品检验局；1980年，更名为长沙进出口商品检验局岳阳商检处,升为处级。1986年6月，更名为中华人民共和国岳阳进出口商品检验局。下设办公室、检验一科、检验二科,负责境内进出口商品检验、鉴定、监管等工作。

为适应岳阳城陵矶一类口岸对外开放的需要,1997年2月,成立岳阳卫生检疫局,隶属长沙卫生检疫局,主要承担岳阳城陵矶口岸及境内出入境人员、交通工具、运输设备及行李、货物、邮包等卫生检疫,并对进口仪器实施卫生监督管理。

1997 年3月,成立岳阳动植物检疫局,隶属国家动植物检疫局,内设办公室、业务科、机关服务中心,承担城陵矶口岸及境内有关进出境动植物检疫工作。1998年5 月，湖南商检局、岳阳动植物检疫局、长沙卫生检疫局成立湖南“三检”临时协调小组。1999年8月，由湖南商检局、岳阳动植物检疫局、长沙卫生检疫局成立湖南出入境检验检疫局。

1999 年8月,成立岳阳“三检”临时协调领导小组。11月,岳阳进出口商品检验局、岳阳动植物检疫局、岳阳卫生检疫局合并组建为岳阳出入境检验检疫局(正处级),下设办公室、检验检疫一科、检验检疫二科、综合科,主要负责境内出入境卫生检疫、动植物检疫、商品检验、鉴定、监管和认证等工作。