境内历来是天花、霍乱、流行性脑脊髓膜炎、白喉、麻疹、百日咳、猩红热、痢疾、伤寒、疟疾、结核、麻风、狂犬病等传染性疾病流行区。当时，无常设卫生防疫和有关科研机构，政府只在流行时采取一些临时性措施，成效不大，死亡甚众。

中华人民共和国成立后，人民政府及时组织卫生防疫机构，培训技术人员,建立卫生防疫网，贯彻“以防为主”的方针,广泛开展爱国卫生运动和防疫工作。医务人员在积极防病治病的同时，围绕最严重的传染病开展防治研究。1953年以后，未发现天花的疫情报告1964年，岳阳专区建立卫生防疫站，在环境、食品、劳动、学校卫生等方面开展防疫工作。1978年，中共十一届三中全会后，境内在疾病防治、卫生监测等方面有较快发展。80年代中期，配合世界卫生组织扩大儿童计划免疫，开展冷链建设。1987～1988年，各县(市)、区先后达到国家标准，实现计划免疫第一个85％，计划免疫质量显著提高。在急性传染病防治方面，除控制和消灭烈性传染病外，流行性脑脊髓膜炎、麻疹、百日咳、脊髓灰质炎等病显著下降，连续4年无白喉病发生。

1988年和1991年，岳阳市分别接受世界卫生组织、联合国儿童基金会和国家卫生部计划免疫覆盖85%的评审验收，确认市、县(市)两级为单位的“四苗”覆盖率达85%以上。1985年，岳阳市基本消灭丝虫病。1994年11月9～15日，经卫生部消灭丝虫病评组对岳阳市进行全面考核验收认为：岳阳市丝虫病传染源已被消除，传播被阻断，达到卫生部颁发的消灭线虫病标准，并颁发合格证书。1991年8月，经省爱卫会组织专家进行严格考核鉴定，岳阳市被省爱卫会授予“湖南省第一个灭蟑达标市”称号，成为中国南方第一个灭蟑达标市。

集中在湘阴、华容、临湘3县的麻风病，经20余年查、收、治、看、研、宣的综合防治，有效地得到控制。1997年10月，经省卫生厅组织专家审评，认定岳阳市以县为单位达到部颁基本消灭麻风病标准。50～60年代，湘阴属中华按蚊为媒介的间日疟疾流行区，发病率为各类传染病发病率首位。经近30年严格坚持“发现─治疗─管理”的综合防治制度，于1997年11月，经省卫生部门实地考核调查，确认该县已达部颁《基本消灭疟疾标准》。